Η ΕΚΑ ιδρύθηκε στις 3 Οκτωβρίου 1946. Το ιδρυτικό Συνέδριο πραγματοποιήθηκε στο «Μαγικό Παλάτι» στην Λευκωσία, αφού προηγήθηκε Παγκύπρια Αγροτική συγκέντρωση 6,000 Αγροτών στο άνοιγμα της πλατείας Κολοκάσι στην Λευκωσία. Έχει κλαδικές Επιτροπές όπως την Αιγοπροβατοτροφία, Αγελαδοτροφία, Πτηνοτροφία, Πατατοπαραγωγούς, Κηπευτικά, Ελαιοπαραγωγούς, δενδροκαλλιεργητές, Αμπελουργούς, βιοκαλλιεργειτές και γενικά όλους τους κλάδους της Αγροτικής Οικονομίας στοχεύοντας στην καλύτερη λειτουργία της οργάνωσης και συμβάλλοντας έτσι στα δρόμενα του πρωτογενή τομέα της Κύπρου. Συμμετέχουμε σε οργανισμούς της Κύπρου όπως το Συμβούλιο Πατατών, τον ΟΓΑ, Επιτροπή Αναδασμού, Συμβουλευτική Επιτροπή Αγροτικών Οργανώσεων και αλλού ενώ διεθνή επίπεδο στην WFO (Παγκύπρια Οργάνωση Αγροτών), στην IFAP, COPA COGECA, της CEJA, θεσμικά Συνδικαλιστικά Όργανα της ΕΕ. Στελέχη της ΕΚΑ διετέλεσαν μέλη της ΕΟΚΕ. Ιδρύσαμε και ασχολούμαστε πιο έντονα με την Κοινοτική Τράπεζα Παραδοσιακών Σπόρων.