Η Ελένη Μαρκαντώνη αποφοίτησε λαμβάνοντας πτυχίο Γερμανικής Φιλολογίας και Μάρκετινγκ από το Old Dominion University στην Virginia των Ηνωμένων Πολιτειών Αμερικής. Ακολούθως απέκτησε μεταπτυχιακό τίτλο από το Πανεπιστήμιο New Haven στο Management & Marketing. Εργάστηκε στις Ηνωμένες Πολιτείες στη Ξενοδοχειακή βιομηχανία και επιστρέφοντας στην Κύπρο εργάστηκε αρχικά στον ξενοδοχειακό τομέα και ακολούθως σε τραπεζική υπεράκτια εταιρεία. Τα τελευταία τριάντα τρία χρόνια κατέχει τη θέση Διευθύντριας Φοιτητικής Μέριμνας στο Ευρωπαϊκό Πανεπιστήμιο Κύπρου, όπου και διευθύνει και το Κέντρο Καριέρας του ΕΠΚ. Έχει συμμετάσχει σε διάφορα Ευρωπαϊκά ερευνητικά προγράμματα και είναι μέλος του Διεθνή Οργανισμού NASPA και του Παγκόσμιου οργανισμού IAESTE. Επίσης, είναι Γραμματέας του Οργανισμού Αγκαλιά Ελπίδας.